Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXO3O43524 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXO3O43524 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms