Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTIFO43310 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTIFO43310 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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