Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRRTM2O43300 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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