Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRTO14522 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
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