Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
E9PCH4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
E9PCH4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9PCH4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E9PCH4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E9PCH4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9PCH4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9PCH4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9PCH4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9PCH4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9PCH4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9PCH4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9PCH4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms