Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DXG7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DXG7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DXG7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DXG7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms