Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTL1A6NKG5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL1A6NKG5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms