Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
HOXD11P31277 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HOXD11P31277 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD11P31277 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD11P31277 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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