Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LAPTM4AQ15012 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAPTM4AQ15012 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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