Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIAQ12857 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
NFIAQ12857 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIAQ12857 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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