Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms