Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VDAC3Q9Y277 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms