Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAF8Q9UPN6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms