Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZMYND8Q9ULU4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms