Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRP68Q9UHB9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms