Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms