Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
XCL2Q9UBD3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms