Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms