Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms