Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms