Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms