Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GDAP2Q9NXN4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms