Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms