Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUA8

ZBTB40, Zinc finger and BTB domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB40Q9NUA8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBTB40Q9NUA8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms