Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms