Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF275Q9NSD4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms