Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT82Q9NSB4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms