Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ASCL3Q9NQ33 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms