Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD3Q9H7E2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD3Q9H7E2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms