Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA6AQ9H2E6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA6AQ9H2E6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms