Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFDQ9GZP0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms