Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms