Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms