Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUS3Q9BZE2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms