Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms