Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCAPERQ9BY12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SCAPERQ9BY12 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms