Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms