Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms