Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms