Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms