Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLF1Q9BQI6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms