Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN18Q99952 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN18Q99952 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms