Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms