Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD5Q99666 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms