Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms