Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms