Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms