Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms