Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms