Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BCANQ96GW7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms